دوره بیوانفورماتیک

در پایان این دوره، دانش‌پذیران قادر خواهند بود:

مفاهیم کلیدی مربوط به طراحی پرایمر، از جمله ویژگی‌های فیزیکی و شیمیایی پرایمر، ترمودینامیک اتصال پرایمر و ملاحظات مربوط به اختصاصیت را توضیح دهند.

از نرم‌افزارهای مختلف طراحی پرایمر برای طراحی پرایمر برای طیف وسیعی از کاربردها، از جمله PCR، qPCR، توالی‌یابی DNA و مهندسی ژنتیک استفاده کنند.

عوامل مؤثر بر موفقیت یک آزمایش مبتنی بر پرایمر را شناسایی و مشکلاتی را که ممکن است در حین طراحی یا استفاده از پرایمرها ایجاد شود، عیب‌یابی کنند.

پرایمرهای خود را برای کاربردهای خاص طراحی و آزمایش کنند.

اهداف دوره

آشنایی دانشجویان با مبانی و روش‌های تحقیقات آزمایشگاهی در حوزه سرطان

کسب تجربه عملی در انجام آزمایش‌های مختلف سلولی و مولکولی مرتبط با سرطان

ارتقای مهارت‌های تفکر انتقادی و حل مسئله

یادگیری اصول نگارش مقاله علمی و چاپ آن در مجلات معتبر بین‌المللی

این دوره پژوهشی به منظور آشنایی دانشجویان تحصیلات تکمیلی (کارشناسی ارشد و دکتری) در رشته‌های مرتبط با علوم زیستی، پزشکی و بیوانفورماتیک با مبانی و کاربردهای بیوانفورماتیک در زمینه طراحی واکسن‌های مبتنی بر شبیه‌سازی ارائه می‌شود. در این دوره، دانشجویان با مفاهیم کلیدی مانند:

تجزیه و تحلیل توالی ژنومی: شناسایی ژن‌های کاندیدای واکسن، پیش‌بینی ساختار و عملکرد پروتئین، آنالیز جهش‌ها و واریاسیون‌های ژنتیکی

شبیه‌سازی مولکولی: مدل‌سازی ساختار سه‌بعدی پروتئین، پیش‌بینی برهمکنش‌های لیگاند-پروتئین، شبیه‌سازی پاسخ سیستم ایمنی

طراحی واکسن مبتنی بر کامپیوتر: شناسایی اپی‌توپ‌های ایمونوژنیک، طراحی واکسن‌های پپتیدی و پروتئینی، پیش‌بینی ایمنی‌زایی و اثربخشی واکسن

در انتهای این دوره دانشجویان باید :

یک آزمایش وسترن بلاتینگ را به طور مستقل طراحی و انجام دهند.

نتایج وسترن بلاتینگ را به درستی تفسیر و تحلیل کنند.

مشکلات و چالش‌های مرتبط با وسترن بلاتینگ را حل کنند.

از وسترن بلاتینگ برای مطالعه پروتئین‌های مورد نظر خود استفاده کنند.